Bisher gab es in Lindau zwei Realschulen: die Maria-Ward-Realschule und die Realschule im Dreiländereck. Die Schüler werden dort getrennt nach Geschlechtern unterrichtet. Dies wird sich zum neuen Schuljahr 2020/2021 ändern: Ab dann können die Kinder und ihre Eltern frei entscheiden, in welche der beiden Realschulen sie gehen möchten. Die gegenseitige Öffnung greift für Schüler, die dann neu in die fünfte Klasse kommen.
Lindau